- 지정업체 상호간(관련업무 수행 및 공동연구)
- 공동연구를 위한 동일법인이나 다른 법인내 비지정업체 연구소('08.10.8일 영개정)
- 지정업체의 부소재지 연구소 연구업무특성상 실험장 등에서 연구해야할 경우
- 연구개발분야에 대한 시험가동 또는 기술지도 등

- 지정업체 상호간(동일 업종 또는 분야)
- 동일 법인내 비지정업체 제조·생산공장(등록공장)
- 제조·생산한 기계·장비 등의 설치 및 시험운영에 따른 기술지도 등

- 3개월 이상 교육훈련 및 파견 : 지방병무청장 승인
- 3월 미만 교육훈련 및 파견, 지정업체간 파견 : 신상이동통보로 승인 갈음
※ 7일 이내 교육훈련 및 파견 : 복무기록표 기재·정리로 승인 갈음

- 국내교육훈련 : 의무종사기간중 통산 6월
- 국내파견근무 : 의무종사기간중 통산 2년(다만, 산업기능요원은 1년)

- 국외여행허가 기간은 의무종사기간중 통산 2년 이내로 하며 이 경우 통산 6월 이내의 국외여행기간은 해당분야에 종사한 것으로 봄
- 전문연구요원이 해당분야와 관련되는 공동연구, 기술연수, 기술지도 등 병무청장이 정하는 국외여행을 하는 경우에는 허가기간 모두를 복무기간으로 인정

- 야간 또는 방송통신에 의한 수업으로 수학하는 경우
- 전문연구요원이 국내교육기관에서 박사과정을 수학하는 경우

- 종사하고 있는 지정업체에서 해고되거나 퇴직한 때 또는 자연계대학원 박사과정의 전문연구요원으로 편입된 사람이 휴학하거나 제적된 때
- 편입당시 지정업체의 해당분야에 종사하지 아니한 때
- 의무종사기간중 통산 8일 이상의 기간을 무단결근한 때
- 해당분야의 기술자격·면허가 취소되거나 정지된 때 또는 후계 농·어업인의 자격이 상실된 때
- 의무종사기간을 35세까지 마칠 수 없는 때
- 교육소집을 정당한 사유 없이 받지 아니한 때
- 휴직하거나 정직 된 때 또는 다른 지정업체로부터 전입한 때
- 후계 농·어업인의 사업장소가 변경된 때
- 의무종사기간중 질병으로 인하여 통산 3월을 초과하는 휴가·휴직 및 결근을 한 때
- 의무종사기간중 3월 미만의 해당분야와 관련되는 국내교육훈련 및 관련업무수행을 위한 파견근무를 실시하게 된 때
- 자연계대학원 박사학위과정의 전문연구요원이 박사학위과정을 수료하고 당해 연구기관의 전문연구요원으로 종사하게 된 때 또는 박사학위를 취득한 때
- 동일법인내 지정업체로 전직하게 된 때
- 무단결근한 때
- 지정업체 간에 파견근무를 하게 된 때
- 전문연구요원이 박사학위과정에 수학하는 때

- 종사중인 지정업체가 휴업·영업정지·직장폐쇄 또는 폐업한 때
- 지정업체가 부도발생으로 조업이 중단된 때
- 지정업체로서 선정기준에 미달하게 된 때 또는 공업분야 제조업체로서 「산업집적활성화 및 공장설립에 관한 법률」에 의한 공장의 등록이 취소된 때
- 지정업체의 명칭 또는 업종의 변경, 연구기관의 규모 및 연구분야의 변경, 소재지의 이전 또는 농업기계사후봉사업소의 인정이 취소된 때

- 전문연구요원의 박사학위과정의 수학기간
- 휴직(근로기준법 규정에 의한 업무상 부상·질병 또는 장애로 인하여 휴직한 기간, 교육소집 중 발생한 부상·질병 또는 장애가 공무상으로 인정된 경우 제외) 또는 정직기간
- 지정업체의 휴업·직장폐쇄 또는 영업정지기간
- 의무종사기간중 통산 6월을 초과하는 국외여행기간 또는 통산 3월을 초과하는 질병으로 인한 휴가·휴직 및 결근기간
- 승선종사자로서 부득이한 사유로 인해 승선대기기간을 초과한 기간
- 지정업체에서 해고된 사람이 노동위원회에 구제신청을 하거나 법원에 해고의 효력을 다투는 소송을 제기하였으나 해고가 정당하다고 확정된 경우 그 진행기간
- 지정업체 변경을 위한 대기 기간중 3월을 초과하는 기간
- 해고의 효력을 다투는 소송으로 인해 편입당시 지정업체의 해당 분야에 종사하지 아니한 기간
- 의무종사기간 중 통산 8일 미만의 무단결근 기간